Saya Otonashi siempre ha vivido como una chica anémica y amnésica bajo el cuidado de su familia adoptiva, pero a pesar de eso es una adolescente normal. Un día es atacada por un quiróptero (un monstruo que tiene forma de murciélago gigante y que se alimenta de la sangre de las personas), y se da cuenta de que ella es la única que puede luchar contra ellos. Después de esto y de la muerte de su padre adoptivo, Saya se muda a Okinawa para seguir luchando contra los quirópteros, y en donde descubrirá la verdadera naturaleza de los quirópteros y su verdadero pasado.