Yuuki Cross es una chica que en su infancia fue atacada por un vampiro y fue rescatada por otro vampiro llamado Kaname Kuran. Kaname la llevó con Kaien Cross, el cual se convierte en su padre adoptivo y más adelante en el director de la "Academia Privada Cross". La Academia está divida en dos clases: la "Clase Diurna" y la "Clase Nocturna". Yuuki y un chico llamado Zero Kiryuu son mediadores y se encargan de que la Clase Nocturna no haga daño a la Clase Diurna. Pero hay un secreto que sólo Yuuki, Zero y Kaien saben: la Clase Nocturna está formada por vampiros, por eso tienen que poner orden. Zero odia a los vampiros con todas sus fuerzas, pero hay una cosa que lo tortura día a día: él también es un vampiro.